Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Epb42P49222 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Epb42P49222 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms