Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rbp3P49194 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rbp3P49194 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms