Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptx3P48759 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms