Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd1P48410 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms