Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx1P48377 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms