Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gli1P47806 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms