Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pax9P47242 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms