Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zic1P46684 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zic1P46684 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Zic1P46684 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms