Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab11bP46638 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab11bP46638 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms