Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms