Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Egr3P43300 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms