Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkx1-2P42580 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkx1-2P42580 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms