Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sept1P42209 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sept1P42209 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms