Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LtbP41155 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LtbP41155 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LtbP41155 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LtbP41155 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LtbP41155 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LtbP41155 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LtbP41155 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms