Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VhlP40338 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VhlP40338 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VhlP40338 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VhlP40338 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms