Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fen1P39749 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fen1P39749 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms