Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PpargP37238 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PpargP37238 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PpargP37238 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PpargP37238 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PpargP37238 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PpargP37238 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PpargP37238 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PpargP37238 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms