Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl12P35979 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl12P35979 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms