Protein–RNA interactions for Protein: P35922

Fmr1, Synaptic functional regulator FMR1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmr1P35922 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fmr1P35922 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fmr1P35922 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms