Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PtprkP35822 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PtprkP35822 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms