Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab18P35293 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab18P35293 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms