Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms