Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptpn11P35235 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptpn11P35235 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms