Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stfa1P35175 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms