Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ptk2P34152 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptk2P34152 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms