Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc5P32043 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms