Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VtnP29788 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VtnP29788 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VtnP29788 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VtnP29788 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VtnP29788 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms