Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RxrgP28705 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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