Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hoxd10P28359 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Hoxd10P28359 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10P28359 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hoxd10P28359 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Hoxd10P28359 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hoxd10P28359 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Hoxd10P28359 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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Hoxd10P28359 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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