Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd9P28357 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms