Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb1P28230 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms