Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms