Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CftrP26361 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CftrP26361 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CftrP26361 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CftrP26361 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CftrP26361 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CftrP26361 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CftrP26361 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CftrP26361 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CftrP26361 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CftrP26361 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CftrP26361 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CftrP26361 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CftrP26361 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CftrP26361 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CftrP26361 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CftrP26361 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CftrP26361 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CftrP26361 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CftrP26361 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CftrP26361 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CftrP26361 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CftrP26361 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CftrP26361 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CftrP26361 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CftrP26361 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms