Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMO2P25791 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMO2P25791 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMO2P25791 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO2P25791 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMO2P25791 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms