Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou2f1P25425 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou2f1P25425 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms