Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdk11bP24788 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms