Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gria1P23818 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gria1P23818 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms