Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd11P23813 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd11P23813 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms