Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm2P23804 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm2P23804 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm2P23804 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm2P23804 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mdm2P23804 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mdm2P23804 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mdm2P23804 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms