Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcgf2P23798 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms