Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZfaP23607 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZfaP23607 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms