Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eif3aP23116 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms