Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RarbP22605 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RarbP22605 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RarbP22605 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RarbP22605 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RarbP22605 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RarbP22605 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RarbP22605 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RarbP22605 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RarbP22605 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RarbP22605 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms