Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou3f1P21952 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou3f1P21952 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms