Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PrkcaP20444 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms