Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pou5f1P20263 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pou5f1P20263 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms