Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PdgfaP20033 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms