Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NefhP19246 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NefhP19246 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NefhP19246 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NefhP19246 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NefhP19246 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NefhP19246 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NefhP19246 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NefhP19246 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms