Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka1P18653 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rps6ka1P18653 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rps6ka1P18653 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rps6ka1P18653 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms