Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Selenbp1P17563 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Selenbp1P17563 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms